Agaviで生成されるmod_rewrite

Agaviのコマンドで生成される.htaccessに書かれているmod_rewirteは

RewriteRule ^$ index.php?/ [QSA,L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule (.*) index.php?/$1 [QSA,L]

これだとディレクトリが存在している場合そちらを表示しようとしてしまいます。なので、/doc-root/hoge/bar.cssというファイルを置いて/hoge/をAgaviで処理するということができません。
そのように処理をさせたい場合は下記のようにします

RewriteRule ^$ index.php?/ [QSA,L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteRule (.*) index.php?/$1 [QSA,L]